Tải xuống
Tóm tắt
Đặt vấn đề: Ngoài các yếu tố độc lực, khả năng đề kháng kháng sinh đã giúp A. baumannii trở thành căn nguyên gây nhiễm khuẩn bệnh viện thường gặp nhất. Các nghiên cứu về cơ chế kháng carbapenem tại Việt Nam cũng theo xu hướng chung là tập trung vào cơ chế kháng phổ biến sinh enzyme carbapenemase. Mục tiêu: Xác định nồng độ ức chế tối thiểu (MIC) của một số kháng sinh với các chủng A. baumannii, tìm mối liên quan giữa mức độ kháng carbapenem và sự xuất hiện các gen mã hóa carbapenemase. Phương pháp: 51 chủng A. baumannii phân lập từ 6 bệnh viện thuộc 3 miền ở Việt Nam. Tách chiết và tinh sạch DNA, sau đó giải trình tự thế hệ mới. Trình tự đọc chất lượng cao được lắp ráp de novo bằng phần mềm SPAdes 3.13.0, dự đoán gene và chú giải chức năng bằng phần mềm Prokka. Kết quả: 8/9 kháng sinh bị kháng trên 70%, 88% số chủng kháng cả 2 kháng sinh thuộc nhóm carbapenem với MIC50, MIC90 lần lượt là 32-64μg/ml và >64μg/ml. Tỷ lệ kháng thấp nhất là colistin (29%) và phân bố dải MIC của colistin từ 1 - 8 μg/ml; MIC50 = 1 μg/ml, MIC90 = 4 μg/ml. Qua sàng lọc gen kháng kháng sinh của 51 chủng từ 4 cơ sở dữ liệu ARG-ANNOT, NCBI, CARD và ResFinder thu được 52 gen kháng kháng sinh, trong đó có 22 gen mã hóa carbapenemase. Nồng độ MIC tăng dần ở các chủng mang đồng thời nhiều gen carbapenemase và càng nhiều gen kháng thì tỷ lệ kháng càng nhiều hơn với nồng độ MIC càng cao. Kết luận: Có mối liên quan giữa MIC với sự xuất hiện một số gen mã hóa carbapenemase (blaOXA-23, blaOXA-66) ở các chủng A. baumannii. Colistin trở thành liệu pháp điều trị cuối cùng trong các trường hợp nhiễm trùng do A. baumannii đa kháng.
công trình này được cấp phép theo Creative Commons Attribution-phi thương mại-NoDerivatives 4.0 License International .
Bản quyền (c) 202 Tạp chí Khoa học và Công nghệ Y Dược
WHO | Global priority list of antibiotic-resistant bacteria to guide research, discovery, and development of new antibiotics. WHO. http://www.who.int/medicines/publications/global-priority-list-antibiotic-resistant-bacteria/en/. Accessed 17 Feb 2021. 2. Lưu Vũ Nga, Phạm Duy Thái, Trần Huy Hoàng. Mối liên quan giữa mức độ kháng carbapenem và sự xuất hiện gen mã hóa carbapenemase của các chủng Acinetobacter baumannii phân lập tại một số bệnh viện. Tạp chí Khoa học và Công nghệ Việt Nam 62(7), (2020)
Trần Diệu Linh. Nghiên cứu ở mức độ phân tử khả năng kháng carbapenem của một số vi khuẩn Gram âm phân lập từ bệnh nhân tại bệnh viện Việt Đức và bệnh viện Trung Ương Quân đội 108 Luận án Tiến sĩ sinh học, Trường Đại học Khoa học tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội, (2020).
Lưu Thị Vũ Nga. Một số gen mã hóa Carbapenemase và mối liên quan với mức độ kháng carbapenem của Acinetobacter baumannii tại Việt Nam Luận án Tiến sĩ Y học, Đại học Y Hà Nội, (2020).
Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing (2017).
CLSI-EUCAST. Recommendations for MIC determination of colistin (polymyxin E) As recommended by the joint CLSI-EUCAST Polymyxin Breakpoints Working Group (2016).
Wareth G, Linde J, Nguyen NH, Nguyen TNM, Sprague LD, Pletz MW, et al. WGS-Based Analysis of Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii in Vietnam and Molecular Characterization of Antimicrobial Determinants and MLST in Southeast Asia. Antibiotics 10, 563 (2021).
Hsu L-Y, Apisarnthanarak A, Khan E, Suwantarat N, Ghafur A, Tambyah PA Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii and Enterobacteriaceae in south and southeast Asia. J C microbiology reviews 30, 1–22 (2017).
Phu VD, Wertheim HFL, Larsson M, Nadjm B, Dinh Q-D, Nilsson LE, et al. Burden of Hospital Acquired Infections and Antimicrobial Use in Vietnamese Adult Intensive Care Units. PLoS ONE 11, e0147544 (2016).
Luo Y-C, Hsieh Y-C, Wu J-W, Quyen TLT, Chen Y-Y, Liao W-C, et al. Exploring the association between capsular types, sequence types, and carbapenemase genes in Acinetobacter baumannii. Int J Antimicrob Agents 59, 106470 (2022).
Hoang Quoc C, Nguyen Thi Phuong T, Nguyen Duc H, Tran Le T, Tran Thi Thu H, Nguyen Tuan S, et al. Carbapenemase Genes and Multidrug Resistance of Acinetobacter Baumannii: A Cross Sectional Study of Patients with Pneumonia in Southern Vietnam. Antibiot Basel 8, E148 (2019).
Alattraqchi AG, Mohd Rani F, A. Rahman NI, Ismail S, Cleary DW, Clarke SC, et al. Complete Genome Sequencing of Acinetobacter baumannii AC1633 and Acinetobacter nosocomialis AC1530 Unveils a Large Multidrug-Resistant Plasmid Encoding the NDM-1 and OXA-58 Carbapenemases. mSphere 6, e01076-20 (2021).
Wang Z, Li H, Zhang J, Wang H. Co-Occurrence of blaOXA-23 in the Chromosome and Plasmid: Increased Fitness in Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii. Antibiotics 10, 1196 (2021).
Haejeong Lee, Juyoun Shin, Yeun-Jun Chung, Myungseo Park, Kyeong Jin Kang, Jin Yang Baek, Dongwoo Shin, Doo Ryeon Chung, Kyong Ran Peck , Jae-Hoon Song and Kwan Soo Ko. Co-introduction of plasmids harbouring the carbapenemase genes, blaNDM-1 and blaOXA-232, increases fitness and virulence of bacterial host. J Biomed Sci 27, (2020).